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1952.06.24. | 교육법 제169조 교육자치제 실시로 해남군교육청 발족 |
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| 1962.01.01. | 교육자치제 폐지로 해남군청 교육과로 편입 | |
| 1964.01.01. | 교육자치제 부활로 해남군교육청 설립 - 학무과, 관리과(2과) 신설 | |
| 1973.02.01. | 교육장하부조직 개정으로 중학교의 지도 감독을 교육장 관할하에 둠 | |
| 1976.09.01. | 직제 개편(2과 6계) - 학무과에 초등교육계, 중등교육계, 사회체육계 신설 - 관리과에 관리계, 경리계, 시설계 신설 |
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| 1979.07.31. | 직제 개편 - 관리과에 서무계 신설 | |
| 1983.04.26. | 과학실험실 설치 | |
| 1991.03.26. | 지방교육자치에관한법률 시행에 따라 「해남교육청」이 「전라남도해남교육청」 으로 기관 명칭 변경 |
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| 1993.09.24. | 신청사로 이전 | |
| 1993.10.27. | 신청사 준공식 | |
| 1996.03.01. | 국민학교 명칭이 초등학교로 변경 | |
| 1998.01.01. | 관리계를 정보관리계로 명칭 변경 | |
| 1999.01.01. | 학무과를 교육과로 명칭변경 직제개편 -「계」조직 폐지 → 「담당제」로 바꿈 |
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2003.01.01. | 직제개편 - 교육과에서 과학정보교육담당 신설(2과8담당) 서무담당을 총무담당, 정보관리담당을 관리담당으로 명칭변경 |
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| 2006.01.01. | 관리과에서 총무담당을 혁신총무담당으로 명칭 변경 | |
| 2008.07.01. | 관리과 혁신총무담당을 총무담당으로 명칭 변경 | |
| 2009.11.10 | 적정규모학교육성 선도군 지원 사업 대상 지역선정(교육부) | |
| 2010.09.01. | 지방교육자치에관한법률 시행령 개정에 따라 전라남도해남교육지원청으로 조직개편 직제 개편(2과 8담당→2과 9담당) - 교육과, 관리과→교육지원과, 행정지원과 - 초등교육담당, 중등교육담당, 사회체육담당, 과학정보담당→교수학습지원, 교원능력개발, 체육청소년지원, 인재육성지원 - 총무담당, 관리담당, 경리담당, 시설담당→행정지원, 교육협력, 재정지원, 시설1, 시설2 |
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| 2011.04.01. | 해남영재교육원 준공식 | |
| 2012.12.07. | 2012. 행정서비스헌장 운영 우수기관 선정(도) | |
| 2013.03.01. | 거점교육청 운영방법 변경에 따른 조직개편(2과9담당→ 2과10담당) 교육지원과 「보건급식담당」신설, 행정지원과 「전산담당」신설, 「시설2담당」폐지 |
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| 2016.03.01. | 직제 개편(2과 10담당→ 2과 10팀) 「담당」제→「팀」제 |
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| 2019.03.01. | 학교지원센터 구축에 따른 조직 개편(2과 10팀→ 2과 1센터 12팀) - 학교지원센터 생활인권팀, 학교지원팀 신설 - 교육지원과 학교혁신팀 신설 - 교육지원과 인재육성지원팀 폐지 - 교육지원과 교수학습지원팀, 체육청소년지원팀을 교수학습팀, 체육복지팀으로 명칭 변경 - 행정지원과 행정지원팀, 재정지원팀을 행정팀, 교육재정팀으로 명칭 변경 |
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| 2020.03.01. | 학교지원센터 구축에 따른 조직 개편
- 교육지원과 유초등교육팀, 중등교육팀 신설 - 교육지원과 교수학습팀, 교원능력개발팀 폐지 |